澳大利亚移民部门最关心的是申请人是否患有肺结核、乙型肝炎、艾滋病和过度肥胖而诱发的疾病。指定医院的医生对申请人体检状况的评价是建议性的，他们会将体检报告和胸透照片直接寄往澳大利亚移民部门，澳大利亚移民部门再将这些材料转往本土的医生，他们最终决定申请人的身体状况是否符合移民标准。如果检查出患有上述疾病或者有任何疑问，移民部门通常会要求申请人再次体检，再次体检必须在原体检医院进行，不能更换医院，再次体检可以是全面的也可以是指定部位的，再次体检通常必须在签发再次体检信日期后的48天内完成，澳大利亚本土的医生需要3个月才能出结果，这就意味着如果发生再次体检情况，移民申请将比普通情况晚3个月被批准。

再次体检仍发现有症状，比如乙肝为活性、艾滋病活性等，会要求申请人进行建议性的治疗，比如服用药物、减肥，或者签署赴澳大利亚后接受定期复查的申请，然后签发永久居留签证。赴澳大利亚进行定期复查是免费的。

澳大利亚政府对申请人没有强制性的免疫规定，但是强烈希望携带子女的申请人在赴澳大利亚之前，对其子女进行结核病、百日咳、白喉、破伤风、小儿麻痹症、腮腺炎、麻疹、风疹的免疫预防，并随身把免疫记录携带到澳大利亚，这样便于入境后的小孩看病。