一般情况下，幽门螺旋杆菌感染性胃炎、萎缩性胃炎、自身免疫性胃炎以及胃部隆起性病变、内镜诊断为息肉的隆起性病灶、平坦性病灶、粘膜皱褶中断的病灶以及溃疡性病灶均应该取活检。局部粘膜病灶也可根据染色放大内镜观察的结果，针对最可疑或最典型的病变部位进行活检，

　　对于幽门螺旋杆菌感染性胃炎在胃窦小弯侧距幽门5cm（邻近胃角处）或胃窦大弯侧正对胃角处取活检1～2块行尿素酶试验或组织病理学诊断。

　　对于萎缩性胃炎在胃角、胃窦距幽门2～3cm的大弯侧和小弯侧，胃体距贲门8cm的大弯侧和小弯侧（胃体中部大小弯），共取5块活检。

　　对于自身免疫性胃炎在胃体、胃底，内镜表现为糜烂、溃疡、结节、息肉、肿块等病变处多部位进行活检。