1、属性不同：（1）中国音乐学院属性：国家首批双一流”世界一流学科建设高校。（2）中央音乐学院属性：全国艺术院校中唯一的国家重点大学和211工程”建设学院，首批双一流”世界一流学科建设学院，国家高水平大学公共研究生项目实施学院，以及社会艺术水平考试机构。

2、创办年代不同：（1）中国音乐学院创办年代：学校成立于1964年，是根据周恩来总理的提议而建立。（2）中央音乐学院创办年代：学校原为1940年在重庆青木关成立、抗战胜利后复员南京的国立音乐院。

3、科研成果不同：（1）中国音乐学院科研成果：共获得师生获金钟奖82项、文华奖124项，获文化部创新奖1项、文化部文化艺术科学优秀成果奖2项。（2）中央音乐学院科研成果：共取得科研成果奖87项，其中省部级以上61项。2013年，学院有国家级项目立项4项。