男主的妹妹叫节子，年龄4岁、清太的妹妹。在神户大空袭后失去了住家及母亲，跟哥哥清太前往远亲家居住。与哥哥搬离到防空洞生活后因营养不良死去。

《萤火虫之墓》讲述了一个衣衫褴褛的少年，气息奄奄地躺在人来人往的车站，正慢慢走向他那14岁短暂生命的终点，这是在战败月余后的日本。空袭开始了，妈妈在轰炸中不幸离世。在突如其来的打击面前，哥哥能做的只是将妈妈死去的消息瞒过年幼的妹妹。在空旷的广场上，哥哥强笑着卖力地为哭着要找妈妈的妹妹表演单杠，夕阳下两个瘦小的身影显得那么的单薄。也许，就是在那一刻，哥哥试图将所有的悲伤扛起，决定在纷乱的废墟上为妹妹擎起一片晴空。兄妹俩只能去投靠亲戚。

然而，战争让亲情疏远，物质的贫乏更使人们彼此冷漠。越来越多的白眼和碗中越来越少的米饭暗示着他们必须离开了。哥哥终于决定带着妹妹搬走，去建造一个属于自己的家。但是，在唱着歌快乐离开的时候，他岂能料到因那战争而不可逆转的悲惨命运。为了让妹妹不再饿肚子，哥哥只好趁飞机轰炸之时冒着生命危险去偷。每当在人去楼空的屋子里找到一些食物，他都会无比的兴奋。在漆黑的废弃山洞中，哥哥将萤火虫捉进蚊帐，漫天飞舞的萤火虫在夏季闷热的深夜里明明灭灭。哥哥将熟睡中的妹妹紧紧抱住，生怕一松手就又会失去。