《使命》收过路费是第1集，这一集讲述了二十一点三十分，白山地委党委召开了一个非常重要的会议。议题只有一个：研究全地区各市县区政法机关主要领导岗位的调整和交流。会议所以在夜间召开，既是为了保密，也是为了避免不必要的干扰。会上，林荫被任命为清水市公安局局长。会后，地区政法委书记何大来对会议的决定耿耿于怀，深为不满，他向地区公安局局长谷志远提出质疑。

与此同时，在清水市，以贺刚和刀疤为首的一伙歹徒冲进一家饭店，疯狂打砸，逼迫店员说出店老板石儒的行踪。得知石儒下落后的贺刚立刻去见光华集团公司总经理郑光军，向他汇报了此事。这时，有人打电话告诉郑光军，新任市公安局局长是一个叫林荫的人，为怕引起不必要的麻烦，他让贺刚赶在林荫到来之前除掉石儒。林荫在谷局长的陪同下，赶往清水赴任，谷局长提醒林荫要做好迎接困难的准备。公路上，以刀疤为首的三人拦住一辆去往清水市的大巴，刀疤声称自己是交通局的收费员要收线费，司机老杨的儿子下车与他理论，称自己已经交过线费，争吵中刀疤等三人对他拳打脚踢，打的他头破血流，一旁的记者苗雨连忙拿起相机，拍下了打人的全过程。

杀死石儒后，贺刚也参与进来，他见杨氏父子已经被整治过，准备与众人离去，不料老杨的儿子却不罢休，嚷嚷着要与他们去公安局评理，这时，林荫来到现场，他阻止了行凶的歹徒，谷局长和司机老张随后也下车来到现场。当得知来人是新任公安局长时，贺刚急忙驾车逃离，刀疤等三人被抓。司机老杨虽然被打的头破血流，却没有丝毫怨言，还一个劲跑去给刀疤三人道歉，老杨请求林荫放了那三人，林荫疑惑不解。当刀疤叫自己林局长的时候，林荫心里感到惊奇，自己还未到清水上任，对方却已经知道自己姓林，这些到底是什么人，他心中充满疑虑。