一、根本原因是超级英雄应不应该受到专门的法律监督。

美队认为不应该，多一个专门管法律对他们不公平，违背了平等自由的精神。钢铁侠认为应该，他们的能力超越了大多数人，所以对他们的限制也应该超越大多数人，不然会造成更大破坏。

二、直接原因是对冬兵的处理。

在钢铁侠等人的推动下，这个针对超级英雄的协议生效。美队等人拒不接受，正好这时候面临着冬兵被栽赃事件。钢铁侠认为冬兵你要接受新法律的制裁。美队认为冬兵只能交给政府，不接受这个新的协议。所以双方在机场打起来，结果美队方战败，鹰眼猎鹰蚁人女巫四人被关押。后来钢铁侠发现了父母的死因，准备杀掉冬兵。钢铁侠认为杀人偿命，要杀了冬兵。美队认为要通过合法程序审判才能处置冬兵。于是在西伯利亚，美队、钢铁侠和冬兵三人打起来。结果钢铁侠战败，美队带着冬兵走了。