徐州矿务集团以前称徐州矿务局、徐州港务集团以前称徐州港务局。简单地讲，原来是政企不分，后来改革了，徐州矿务局改称徐州矿务集团，徐州港务局改称徐州港务集团。徐州港务集团公司是京杭大运河上的大型港口企业。集团公司目前下辖万寨港、邳州港、双楼港、孟家沟港4个主要港口。

在徐州还有一个机构叫徐州市港口管理局，徐州市港口管理局的主要职责是:贯彻执行国家关于方针、政策、法律、法规及规章;组织编制港口总体规划，制定港口章程;拟定并执行全市港口发展战略、产业政策和规范性文件;制定全市港口发展规划和年度计划，并组织实施;负责对全市港口的岸线、陆域、水域实施统一的行政管理;负责对全市港口建设市场秩序、经营秩序、安全生产、环境保护等实施监督和管理，征收国家有关行政费收;负责协调重点物资、军事及抢险救灾等物资的运输;负责港口信息的汇总、统计和管理工作;负责对港口从业人员的技术、业务培训、考核和发证的管理工作。

2011年徐州市港口管理局更名为徐州市港口管理处，更名后，徐州市港口管理处仍为隶属于市交通运输局相当于副处级全额拨款事业机构。