治疗肠炎的药物按病因有分为两大类，第一类为急性肠炎，跟细菌感染或病毒感染有直接关系，常常表现为最近2-3天有发热、腹痛、腹泻等症状，可以通过化验大便常规和血常规明确，需要用诺氟沙星或头孢三代一类的抗生素抗感染治疗。如果是病毒引起的，需要用抗病毒口服液来治疗。第二类为慢性结肠炎，多表现为肠道菌群有失调，肠道黏膜有充血水肿，可以通过做电子结肠镜等明确。在确诊后主要通过调理肠道菌群的药物和保护肠黏膜的药物治疗，常用的有整肠生、金双歧、培菲康和复方谷氨酰胺肠溶颗粒。另外，在肠炎发作时，饮食的调理也很重要，要以清淡的饮食为主。