1、并购贷款业务风险防范：与一般的商业贷款相比，并购贷款的复杂性和风险性更高，并购的风险也较大，加大了银行在并购贷款风险管理上的难度。
2、商业银行并购贷款人才匮乏：按照目前国内商业银行投资银行部的实际操作水平，要完成包括并购贷款业务受理、尽职调查、风险评估、合同签订、贷款发放、贷后管理在内的多项主要并购环节的管理控制工作，难度系数相当大。
3、股权投资存在法律障碍问题：并购贷款的放行也引发了对商业银行从事股权投资问题的关注，商业银行未来将作为一方主体参与到有贷款支持的并购交易中，一旦并购失败，商业银行将可能被动成为股权承接者，然而，按照我国现行的法律规定，商业银行在持有用于抵债的股权问题上尚存在法律障碍。
4、并购贷款业务客户资源储备不足问题：现在并购贷款的客户选择，倾向于选择国有大型企业并购项目，还有较为熟悉的传统客户国有大型企业，这样有利于其风险管控措施的实施。
1、利用杠杆效应增加投资回报：并购方可利用一部分自筹资金即可完成收购，而且并购贷款融资费用较固定，并购方可在最大限度上享受被收购企业业务价值增长所带来的回报。
2、资金成本较低：相对股权融资，通过银行债务类融资资金成本较固定，且成本较低。
3、期限较长：并购贷款期限可达5年，满足并购业务长期投资的需求。
4、资金稳定：并购业务通常较为复杂，银行资金来源稳定，可减少并购方资金安排不合理致使资金链断裂的风险。
5、税收优势：并购贷款利息可作为费用抵扣缴税基数。
并购贷款，即商业银行向并购方企业或并购方控股子公司发放的，用于支付并购股权对价款项的本外币贷款，所以并购贷款可以购买商业房产。并购贷款投向房地产开发土地并购或房地产开发土地项目公司股权并购的，应按穿透原则管理，拟并购土地项目应完成在建工程开发投资总额的25%以上。是针对境内优势客户在改制、改组过程中，有偿兼并、收购国内其他企事业法人、已建成项目及进行资产、债务重组中产生的融资需求而发放的贷款。并购贷款是一种特殊形式的项目贷款。并购贷款是针对境内优势客户在改制、改组过程中，有偿兼并、收购国内其他企事业法人、已建成项目及进行资产、债务重组中产生的融资需求而发放的贷款。并购贷款是一种特殊形式的项目贷款。普通贷款在债务还款顺序上是最优的，但如果贷款用于并购股权，则通常只能以股权分红来偿还债务。
1、并购目标不明确：企业主一定要明确自己并购的目的，并购后组建的新企业要朝什么方向发展，并购并不是简单的融资，还可以帮助企业进行产业转型。在这种情况下，并购者必须对并购对象进行详细分析，并且对并购后新企业的发展战略目标也要有详尽的了解。目标不明确的并购往往会以失败告终。其次，企业并购定位失误也会导致并购的失败，企业对并购涉足的领域定位不明确，这样往往会造成主业不突出，竞争力削弱，企业经营陷入困境。
2、对目标企业调查了解不够深入：企业受主观和客观因素的影响，对目标企业的认识并不深入，很可能对目标企业的价值估计不准确，导致某些看似符合企业并购战略而实际上对并购方来说并不适应的企业成为了并购目标。
3、并购后整合不力：不同的企业有自身不同的特色，原来不同的业务领域、管理风格和文化背景等的企业一旦合二为一，不可避免地产生一定的冲突。这些冲突如果处理不好，非常容易导致并购的失败。
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